Vi tror på öppen och tillgänglig vetenskap. All programvara och alla data från våra publikationer görs fritt tillgängliga. Om du har frågor eller stöter på problem får du gärna öppna ett ärende i respektive GitHub-repositorium.
Ett ramverk för att utvärdera "spatial coherence" i nätverk som används i sekvenseringsbaserad mikroskopi. Paketet erbjuder mått som inte kräver ground truth för att bedöma hur väl ett nätverks topologi bevarar ursprungliga spatiala relationer i 2D eller 3D genom att mäta dess överensstämmelse med euklidiska geometriska lagar.
pip install network-spatial-coherence
pip install alphamorph
pip install strnd
Intertangler/spatial_tolerance: första versionen av Spatial Tolerance